河南科技学院生物工程学科始建于1986年，历经专科、本科和研究生三个办学阶段，生物工程本科专业为省级一流本科专业、省级特色专业、省级专业综合改革试点专业、省级本科工程教育人才培养模式改革试点专业。生物工程2023年获批为河南省重点学科。学科现建有现代生物育种协同创新中心、河南省合成生物学工程技术研究中心、郑洛新国家自创区生物医药创新与转化平台等省部级科研平台。学科长期聚焦地方经济发展需求，持续助力破解区域性发展难题，在生物疫苗研发、酒类风味科学与质量控制、中药种质资源和活性成分鉴定及食药用真菌活性物质的开发和利用等方面形成了优势。生物工程一级学科硕士学位授权点2025年获批并开始招生，主要研究及培养方向为：基因工程、动植物细胞工程、微生物发酵工程。学科现有中原科技创新领军人才、河南省特聘教授、河南省学术技术带头人、河南省高校青年骨干教师、河南省高校科技创新人才等10余名。学位点依托中原智能医学实验室、河南省作物基因组编辑工程技术中心、河南省药物合成生物学工程技术研究中心等省级科研平台，承担科技部重点研发计划课题以及其他国家级重大、重点项目，与华兰生物、百威啤酒等国内多家知名企业合作，获批多项千万元以上横向合作项目。